纳米孔三代测序在HIV/AIDS合并肺部感染者快速病原学鉴定
HIV/AIDS患者由于天然免疫,细胞和体液免疫受损,常合并各种机会性感染,其中肺部感染是HIV/AIDS患者最常见的机会性感染。HIV/AIDS肺部感染常为多种致病菌混合感染,且反复发生。严重的肺部感染常合并呼吸衰竭,是HIV/AIDS患者死亡率上升的主要原因,而快速准确的病原学诊断对治疗肺部感染和减少患者死亡率至关重要。
目前,二代宏基因组测序技术已广泛用于临床,能对样本的微生物构成进行准确鉴定,但其受限于实验原理,测序速度相对较慢。根据报道,纳米孔三代测序(Oxford Nanopore Technologies)相对于二代测序对样本病原学鉴定具有更快速且能保持准确性的优势。
对于感染性疾病,确定病原体的时间非常重要,建立快速病原鉴定的方法对合理使用抗感染药物有重要的指导作用。传统的细菌和真菌培养技术耗时较长,且微生物培养的阳性率受限于方法学和抗菌素治疗的影响,大部分的细菌和真菌在常规的培养条件下难以生长。
目前,随着高通量测序技术的发展,二代宏基因组测序(Illumina和IonPGM测序等平台)已广泛应用于科研和临床诊疗,其结果可指导临床合理使用抗菌药物,提高临床疗效,改善患者预后,二代测序对微生物检测的灵敏度和准确性高。
阴阳对算法优化BP神经网络模型对艾滋病报告率的预测
目前全国艾滋病报告率总体呈上升趋势,且地域分布差异大,近年来,学者们采用多种方法进行艾滋病预测研究,主要包括支持向量机、神经网络、动态隔间模型、变系数回归模型等。其中,BP神经网络具有较强的非线性映射能力以及自学习能力,被广泛应用于疾病预测领域,如预测乳腺癌诊断结果、检测人体肾脏疾病、预测心血管疾病、预测乙类传染病报告数等。但是BP神经网络的初始权值和阈值随机,导致学习效率低,容易陷入局部极小点。如何确定BP神经网络的初始权值和阈值,是优化BP神经网络重要的研究方向。其中遗传算法因其优秀的全局搜索能力,被广泛应用于BP神经网络的优化,并取得了不错的效果。
阴阳对优化算法(Yin-Yang-Pair Optimization,YYPO)是Varun Punnathanam等于2016年提出的一种新的元启发式算法,主要针对无约束单目标优化问题。大多数元启发式方法基于特定的机制建立模型,但YYPO算法不同,为平衡开发与探索这两个具有冲突但又相辅相成的任务,算法使用两个点集(P1和P2),其中P1的重点在于开发变量空间,P2的重点在于探索变量空间,以有效确定最优解,点集的数量依赖于问题的维度,这种自适应能力有助于算法处理不同维度的问题。
针对艾滋病发病率预测有助于疾病防控以及BP神经网络易陷入局部极小值的问题,提出基于阴阳对算法优化BP神经网络预测艾滋病发病率。YYPO算法使用两个分别具有开发和探索能力的点集,通过分裂阶段和存储阶段寻找最优解,优化了BP神经网络易陷入局部极值的问题,相比于目前应用较广泛的GA-BP神经网络模型,YYPO-BP神经网络模型可以更好地预测艾滋病发病率以及变化趋势。综上所述,YYPO算法在优化BP神经网络上取得不错的效果,YYPO-BP神经网络模型在疾病发病率的时间序列预测上有很好的适用性,为疾病整体的监测提供帮助。
铂鑫生物亚甲蓝(MB)/光化学病毒灭活技术对血浆中HIV的抑制作用
根据铂鑫生物公开的专利文件CN108578693B《用于治疗艾滋病的自体血浆灭活疫苗的光化学制备方法》披露,通过自体灭活的HIV制备的疫苗可以成功激活患者自体针对于体内变异HIV的特异性免疫,无需服用任何抗病毒药物就可以达到长期控制HIV病毒的效果。
铂鑫生物的HIV自体免疫疗法及其艾滋病治疗仪则已经迈开了商业化的步履,再一次领跑国际。据悉,目前铂鑫生物的艾滋病治疗仪正进行三期临床试验,公司计划在今年第二季度申报上市申请,并预计将在今年第四季度取得三类医疗器械设备许可,取得NMPA批件。
据悉,铂鑫生物的艾滋病治疗仪,采用的是亚甲蓝(MB)/光化学病毒灭活技术,其艾滋病治疗仪的治疗原理如下:
通过艾滋病治疗仪,采集患者分离血浆中的游离病毒,再进行灭活并回输,直接降低血液中活病毒的数目,即令病毒载量下降;立即缓解了患者体内免疫系统的压力,为患者免疫系统的重建提供了宝贵的时间窗口;同时针对血浆中HIV病毒的核心遗传物质(即核酸RNA)进行摧毁,从而避免了耐药的可能。
通过血浆内病毒采集,得到包含所有变异病毒的样本信息,艾滋病治疗仪灭活HIV病毒核酸的同时,保留了病毒完整的免疫原性,把大剂量的保留免疫原性的病毒直接制备成自体全息疫苗;通过把大剂量的保留免疫原性病毒的血浆回输,与体内免疫细胞结合产生免疫应答,最终达到临床治疗效果。
在试验过程中,BX-1艾滋病治疗仪通过630nm单波长照射含有1µmol/L亚甲蓝的病毒血浆2min以后即可有效灭活所验证的HIV-1指示病毒。照射2min、5min、l0min、20min、40min病毒降低量均≥5.17-5.67LgTCID50,照射40min后的血浆样品,分别加入敏感细胞盲传三代,均无病毒检出。此次验证试验结果显示,BX-I艾滋病治疗仪对所选HIV-1指示病毒的体外灭活效果有效。
铂鑫生物在2018年4月成功申报了其血浆病毒灭活仪的发明专利(专利号:201810368896.7),同时亦取得其“用于治疗艾滋病的自体血浆灭活疫苗的光化学制备方法”的发明专利(专利号:201810368096.5)。同年5月,铂鑫生物“非药物融合阻断疗法治疗HIV/AIDS有效性和安全性研究”课题通过国家著名艾滋病防控专家组的验收。
据悉铂鑫生物的艾滋病治疗仪预计将于2021年Q2申报上市申请,并于2021年Q4取得三类医疗器械设备许可。
随着其三期临床试验的展开,及艾滋病治疗仪上市申请程序的启动,全球艾滋病患者有望尽早在市场上看到这个新型的艾滋病治疗仪,并亲身体验铂鑫生物的艾滋病自体免疫疗法,看是否能因此受益。
近期市场亦传闻铂鑫生物将启动赴港IPO,这几年港股IPO赛道持续火热,尤其是2018年香港上市新规施行后,未盈利生物科技公司扎堆涌向港股,铂鑫生物此行也算赶上热潮,且看其进军香港资本市场的道路会否顺利吧。